DISERTASI dan TESIS Program Pascasarjana UM, 2016

Ukuran Huruf:  Kecil  Sedang  Besar

Pengembangan Buku Pengayaan Analisis Virtual Screening Senyawa Alami Kandidat Agonis PPAR-Gamma dalam Proses Aging untuk Matakuliah Biologi Sel di Universitas Negeri Malang

Ritia Rahmawati

Abstrak


ABSTRACT

 

Rahmawati, Ritia. 2016. Pengembangan Buku Pengayaan Analisis Virtual Screening Senyawa Alami Kandidat Agonis PPAR-Gamma dalam Proses Aging untuk Matakuliah Biologi Sel di Universitas Negeri Malang. Program Studi Pendidikan Biologi, Pascasarjana, Universitas Negeri Malang. Pembimbing: (I) Prof. Dr. Agr. Mohamad Amin, S.Pd., M.Si., (II) Dr. Umie Lestari, M.Si.

Kata kunci: Biologi Sel, Virtual Screening, Buku Ajar

Biologi sel merupakan salah satu matakuliah Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Negeri Malang. Referensi yang digunakan dalam pembelajaran matakuliah Biologi Sel belum ada referensi yang berbasis penelitian bioinformatika dengan bahasa Indonesia sebagai bahasa pengantar. Berdasarkan hasil angket analisis kebutuhan mahasiswa menunjukkan mahasiswa hanya mengetahui materi aging secara teori saja, serta proses penuaan terjadi pada kulit dan disebabkan oleh paparan sinar ultraviolet (uv). Selain itu, 95% responden menyatakan bahwa belum mengetahui protein yang berperan dalam proses aging. PPAR-Gamma merupakan salah satu protein yang berperan dalam proses aging. Dalam proses anti aging, aktivitas PPAR-Gamma diinduksi oleh suatu ligan tertentu. Untuk mengetahui aktivitas PPAR-Gamma dalam proses anti aging perlu dilakukan virtual screening. Virtual screening menggunakan webserver Mobyle dan software PyRx 0.8 . Hasil virtual screening antara PPAR-Gamma dan ligan akan dikembangkan menjadi sebuah buku pengayaan. Model yang digunakan dalam pengembangan buku pengayaan adalah model pengayaan ADDIE. Tujuan penelitian ini adalah untuk memprediksi senyawa alami kandidat agonis protein PPAR-Gamma dan mengembangkan buku ajar Biologi Sel berdasarkan hasil penelitian tahap 1

Penelitian dilakukan melalui dua tahap, yaitu penelitian tahap I dan penelitian penelitian tahap II. Penelitian tahap I merupakan penelitian in silico dengan menggunakan metode virtual screening untuk mencari senyawa alami kandidat agonis PPAR-Gamma dalam proses aging. Penelitian penelitin tahap II merupakan penelitian pengembangan buku ajar yang berisi hasil penelitian tahap I. Pengumpulan data dilakukan dengan menggunakan instrumen penilaian buku ajar oleh validator ahli (ahli materi dan ahli media pembelajaran) dan lembar uji coba perorangan. Instrument penilaian buku ajar oleh validator ahli mengadopsi instrumen penilaian buku non teks yang disusun pusat perbukuan pada tahun 2014.  Uji coba perorangan dilakukan terhadap 10 responden dengan kriteria mahasiswa Universitas Negeri Malang yang telah mengikuti dan lulus mata kuliah Biologi Sel.

Hasil penelitian adalah sebagai berikut. 1) senyawa ochnaflavone dengan kode ZINC28462577 memiliki potensi sebagai kandidat agonis PPAR-γ karena sama-sama mengikat Cys285 dan Arg288 melalui interaksi hidrofobik dan 2) buku ajar yang dikembangkan memiliki persentase penilaian sebesar 80% untuk validator ahli dan 89% untuk uji coba perorangan. Hasil validator ahli dan uji coba perorangan menunjukkan buku ajar “Identifikasi Senyawa Alami Kandidat Agonis PPAR-Gamma secara In Silico” layak digunakan dalam matakuliah Biologi sel dengan beberapa revisi.

ABSTRACT

 

Rahmawati, Ritia. 2016. The Enrichment Textbook Development of an Analysis of Natural Compounds of Virtual Screening PPAR-Gamma on Aging Process for Biology Courses in State University of Malang. Biology Education Department, Postgraduate, Universitas Negeri Malang. Consultants: (1) Prof. Dr. Agr. Mohamad Amin, S.Pd., M.Si., (2) Dr. Umie Lestari, M.Si.

Keywords: Cell Biology, Virtual Screening, Textbook

Cell Biology is one of the subjects in the Biology Education Department of State University of Malang. References used in Cell Biology teaching have not been based on Bioinformatics research using Indonesian language as the language of the instruction. According to the result of Students needs analysis questionnaire, it shows that the students only know the aging material in the theory, and aging process happens in skin caused by ultraviolet ray exposure. Besides that, 95% of the respondents states that they do not know the protein involved in aging process. PPAR-Gamma is one of the protein involved in aging process. In anti-aging process, PPAR-gamma activity is induced by a specific ligand. To investigate the activity of PPAR-gamma in anti-aging process, virtual screening is needed to be done. Virtual screening uses a web server and software PyRx Mobile 0.8. Virtual screening results between PPAR-gamma and ligands will be developed into an enrichment book. The model used in the development of enrichment books is ADDIE enrichment model. The purpose of this research was to predict the natural compound of PPAR-gamma protein agonist candidate and develop Cell Biology textbooks based on research results of phase I.

The research was conducted in two stages, namely phase I research and phase II research. Phase I research is in silico research using virtual screening method to find natural compound of PPAR-Gamma agonist candidate in aging process. Phase II research is development research of textbook that contains the results of phase I research. The data collection was done by using the assessment instrument of textbook by validator experts (subject experts and instructional media experts) and sheets of individual testing. Textbook Assessment instruments by validator experts adopt non textbook assessment instruments compiled by book center in 2014. Individual testing was conducted to10 respondents having criteria: Malang State University students who have attended and passed the Biology Cell material.

 

The results of the study are as follows. (1) ochnaflavone compound with ZINC28462577 code has the potential as PPAR-γ agonist candidates for equally binding Cys285 and Arg288 through hydrophobic interactions, and (2) the textbook developed has assessment  percentage of 80% for validator experts and 89% for individual testing. The results of expert validation and individual testing showed that the textbook "Identification of Natural Compounds of PPAR-Gamma Agonists Candidates by In Silico" is eligible to use in the Cell Biology material with some revisions