SKRIPSI Jurusan Biologi - Fakultas MIPA UM, 2018

Ukuran Huruf:  Kecil  Sedang  Besar

Identifikasi Protein Membran Luar Bakteri Serratia liquefaciens Sebagai Kandidat Vaksin Nosokomial

Bella Pradina Novinda Wardani

Abstrak


ABSTRAK

 

Wardani, Bella Pradina Novinda. 2018. Identifikasi Protein Membran Luar Bakteri Serratia liquefaciens Sebagai Kandidat Vaksin Nosokomial. Skripsi, Jurusan Biologi, Fakultas Metematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Malang. Pembimbing: (I) Dr. Umie Lestari, M.Si, (II) Dr. Endang Suarsini, M.Ked.

 

Kata kunci: aktivitas fosforilasi protein, kandidat vaksin, protein membran luar, reseptor glikoprotein, Serratia liquefaciens

Infeksi nosokomial merupakan salah satu jenis infeksi sekunder yang didapatkan setelah 48 jam pasien dirawat di rumah sakit. Salah satu penyebab infeksi tersebut adalah bakteri Gram negatif yaitu, Serratia liquefaciens. Jumlah penderita infeksi nosokomial yang disebabkan S.liquefaciens mengalami peningkatan setiap tahunnya, hal ini disebabkan oleh tingkat resistensi terhadap antibiotik, sehingga perlu dikembangkan jenis pengobatan lain. Alternatif yang ditawarkan yaitu menggunakan protein membran luar sebagai kandidat vaksin. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui profil protein membran luar bakteri S.liquefaciens serta mengukur aktivitas fosforilasi protein dan uji reseptor glikoprotein pada berat molekul 56 kDa dan 36 kDa sebagai kandidat vaksin.

Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif eksploratif dengan eksperimen laboratorik dengan analisis aktivitas fosforilasi dan uji reseptor glikoprotein membran luar bakteri S.liquefaciens. Obyek dalam penelitian ini adalah protein membran luar bakteri S.liquefaciensyang berasal dari Laboratorium Mikrobiologi Jurusan Biologi FMIPA Universitas Negeri Malang. Penelitian dilaksanakan diLaboratorium Biologi Molekular dan Laboratorium Mikrobiologi FMIPA Universitas Negeri Malang, dan laboratorium Biomedik Universitas Brawijaya Malang. Tahapan penelitian terdiri atas: (1) Kultur dan pertumbuhan bakteriS.liquefaciens; (2) Pemisahan membran luar dengan pemotongan pili bakteri S.liquefaciens; (3) Isolasi protein membran luar bakteri S.liquefaciens; (4) Elektroforesis SDS PAGE dan Penentuan berat molekul protein membran luar bakteri S.liquefaciens; (5) Elektroelusi untuk memperoleh protein membran luar dengan berat molekul 56 kDa dan 36 kDa; (6) Pengukuran Aktivitas Fosforilasi Protein; (7) Pewarnaan Glikoprotein.

Hasil penelitian menunjukkan bahwa elektroforesis SDS-PAGE crude protein membran luar bakteri S.liquefaciens menunjukkan 11 pita yaitu90 kDa;80 kDa; 56 kDa; 51 kDa; 36 kDa; 29 kDa; 24 kDa; 19 kDa; 14 kDa; 10 kDa; dan 8 kDa. Perhitungan akvititas fosforilasi protein membran luar bakteri S.liquefaciens 56 kDa memiliki aktivitas fosforilasi sebesar 16,931 x 10-2µmol/mL.menit, sedangkan protein dengan berat molekul 36 kDa memiliki nilai aktivitas fosforilasi sebesar 17,851 x 10-2µmol/mL.menit. Pewarnaan glikoprotein menunjukkan hasil negatif. Protein membran luar bakteri S.liquefaciens dengan berat molekul 56 kDa memiliki aktivitas fosforilasi relatif rendah dari pada protein dengan berat molekul 36 kDa sehinga lebih berpeluang untuk digunakan sebagai kandidat vaksin.

 

SUMMARY

 

Wardani, Bella PradinaNovinda. 2018. Identification of Outer Membrane Protein Serratialiquefaciens as a nosocomial vaccine candidate. Bachelor Thesis. Departement of Biology, Faculty of Mathematics and Science, State University of Malang. Supervisior: (I) Dr.Umie Lestari, M. Si (II) Dr.EndangSuarsini, M.Ked.

 

Keywords: Activity of Protein Phosphorilation,vaccine candidate,Outer Membrane Protein,Glikoproteinreseptor,Serratialiquefaciens.

Nosocomial infection is one of the second infection with achieved after 48 hours treatment in hospital. One of the cause is Gram negative bacteria,namely Serratialiquefaciens. The number of nosocomial infections is caused by S.liquefaciens increasing every year, moreover the resistance of antibiotics, the new way to treat resistancy need to be found. The offered way is used outer membrane protein S.liquefaciens and measuring acivity of Protein Phosphorilation and Glikoproteinreseptor at 56 kDa and 36 kDa as vaccine candidate.

This research is eksplorative descriptive research with laboratoric experimental was done with acivity of Protein Phosphorilation of outer membrane protein S.liquefaciens at 56 kDa and 36 kDa. The object of research is the outer membrane protein S.liquefaciens was cultured in Nutrient Agar medium dan Brain Heart Infusion for the next step. S.liquefaciens was pured from Microbiology Laboratory, Departement of Biology, Faculty of Mathematics and Science. State university of Malang. The research was done in Microbiology Laboratory and Biology Moleculer, Departement of Biology, Faculty of Mathematics and Science. State university of Malang Biomedic Laboratory University of Brawijaya. The step include ( 1) Cultured S.liquefaciens ; (2) outer membrane protein isolation by cut the pilli of S.liquefaciens; (3) isolation of Outer Membrane Protein;(4) SDS-Page Electrophoresis dan determined molecule weight of outer membrane protein. (5) Electroelution to isolate 56 kDa and 36 kDa (6) Measured of activity of Protein Phosphorilation (7) GlikoProtein staining.

The result of this research showed from SDS-PAGE Electrophoresis in the protein crude outer membrane protein S.liquefaciensshowe 11 proteins bands, i.e: 90 kDa;80 kDa; 56 kDa; 51 kDa; 36 kDa; 29 kDa; 24 kDa; 19 kDa; 14 kDa; 10 kDa; and 8 kDa. The measured of activity of Protein Phosphorilation of 56 kDa has 16,931 x 10-2µmol/mL.minute meanwhile the 36 kDa has 17,851 x 10-2µmol/mL.minute. The glicoprotein staining showed the negative result. The 56 kDaouter membrane protein of S.liquefaciens have a low activity of phosphorylation than the 36 kDa outer membrane protein, so so it is more likely to be used as a vaccine candidate.